2014 m. Liepos 8 d., Antradienis. „Vall d'Hebron Institut de Recerca“ (VHIR) tyrėjų komanda dalyvavo tarptautiniame tyrime, kurio metu žmogaus mikrobiotoje (žarnyno floroje) buvo nustatyta 518 naujų, iki šiol nežinomų mikrobakterijų.
Tyrimas, kurio metu mokslininkai pritaikė naują bioinforminės analizės metodą, taip pat išplėtė žinomų mikrobų genų katalogą - nuo 3 iki 10 mln.
Šio tyrimo, kurį sekmadienį paskelbė žurnalas „Nature Biotechnology“, dalis yra Europos projekto „MetaHIT“ (žmogaus žarnyno metagenomika), kuriam skirta 11, 4 milijono eurų, tyrimui, kaip žmogaus mikrobiomas susijęs su sveikata ir ligomis. . „Vall d'Hebron Institut de Recerca“ (VHIR) yra vienas iš 13 šiame projekte dalyvaujančių asmenų - ir vienintelis Ispanijos centras - vadovaujamas daktaro Francisco Guarnerio, kuris paaiškino, kad ne visi tirti pavyzdžiai turi šią nežinomų rūšių skaičius.
Kai kurių asmenų žarnyno floros mėginiuose yra labai mažai šių rūšių ir, išsamiai išanalizavus, matyti, kad tai yra pacientų, sergančių Krono liga, pavyzdžiai. „Tai rodo, kad šios rūšys, iki šiol nežinomos, galbūt yra tos, kurios daro skirtumą tarp sveikų žmonių ir sergančiųjų mikrobiotos“, - paskelbė Guarneris.
Anot tyrėjo, šie duomenys atveria strategijas, kaip bandyti atkurti šias rūšis mitybinėmis intervencijomis: skiriant skaidulas, prebiotikus, kurie padeda selektyviai auginti kai kurias rūšis, arba probiotikus.
Šios nežinomos bakterijos greičiausiai yra vadinamosios gerosios bakterijos, nes jos nėra tipiškos infekciją sukeliančios bakterijos, taip pat nėra žinomos ar išskirtos anksčiau. Anot Guarnerio, aptiktos bakterijos negali būti išskirtos, nes "beveik neabejotinai jos neišgyventų už storosios žarnos, kad būtų persodintos".
Už darbą atsakingas asmuo ir VHIR fiziologijos ir virškinimo patofiziologijos grupės tyrėjas nurodė, kad aptiktos naujos rūšys „nėra auginamos, yra labai jautrios deguoniui, tai yra, yra labai griežtos anaerobų rūšys ir sukuria didelę priklausomybę nuo savo aplinkos, kad galėtų. išgyventi “. „Dėl tos pačios priežasties, eidami į duomenų bazes, neradome pėdsakų ir iki šiol nieko apie juos nežinojome“, - sakė A. Guarneris.
Atradimas buvo įmanomas dėl naujo požiūrio į bioinformatinę analizę, kuri leido šioms rūšims „virsti“.
"Šiuo metu, pasak Guarnerio, tik 10% sekvenuotos genetinės medžiagos yra žinomi 95% patikimumu. Tai palieka didžiulę pilką sritį, kurioje šiuo metu dirbama."
Tyrimo metu buvo aptikta 741 skirtinga metagenominė rūšis, pavadinta dėl negalėjimo jiems priskirti pavadinimo. Priešindamiesi duomenų bazėms, tyrėjai pamatė, kad 115 iš šių rūšių jau buvo žinomos, o 518 - nežinomos; likę 108 yra iš dalies žinomi.
"Dabar mes žinome, kaip atrodo šių metagenominių rūšių genomas, bet ne jų vardus ir pavardes", - aiškino Guarneris.
Nedaug yra tokių rūšių, kurios nėra žinomos, tačiau jų lytis ar šeima, kuriai jie priklauso, ir maždaug 200 aprašytųjų metagenominių rūšių niekaip negali būti klasifikuojamos, nes daugiau nei 80% jų genų yra visiškai nežinomi. šiandien
Mokslininkų teigimu, žmonėse gyvenančių mikroorganizmų yra apie 100 milijardų, tai yra 10 kartų daugiau nei bendras žmogaus ląstelių skaičius.
Pradiniai to paties projekto rezultatai, 2010 m., Parodė 3 300 000 skirtingų genų, paverčiamų 20 000 skirtingų funkcijų, iš kurių 5000 iki šiol nebuvo visiškai žinomi.
Kiekvienas žmogus turi apie 600 000 šių mikrobų genų ir 300 000 nuolat kartojasi tarp visų asmenų. „Šiame naujame tyrime skaičius padauginamas iš trijų ir pasiekiama 9 879 896 skirtingi genai“, - teigė A. Guarneris.
Šaltinis:
Žymės:
Išsiregistruoti Psichologija Mityba
Tyrimas, kurio metu mokslininkai pritaikė naują bioinforminės analizės metodą, taip pat išplėtė žinomų mikrobų genų katalogą - nuo 3 iki 10 mln.
Šio tyrimo, kurį sekmadienį paskelbė žurnalas „Nature Biotechnology“, dalis yra Europos projekto „MetaHIT“ (žmogaus žarnyno metagenomika), kuriam skirta 11, 4 milijono eurų, tyrimui, kaip žmogaus mikrobiomas susijęs su sveikata ir ligomis. . „Vall d'Hebron Institut de Recerca“ (VHIR) yra vienas iš 13 šiame projekte dalyvaujančių asmenų - ir vienintelis Ispanijos centras - vadovaujamas daktaro Francisco Guarnerio, kuris paaiškino, kad ne visi tirti pavyzdžiai turi šią nežinomų rūšių skaičius.
Kai kurių asmenų žarnyno floros mėginiuose yra labai mažai šių rūšių ir, išsamiai išanalizavus, matyti, kad tai yra pacientų, sergančių Krono liga, pavyzdžiai. „Tai rodo, kad šios rūšys, iki šiol nežinomos, galbūt yra tos, kurios daro skirtumą tarp sveikų žmonių ir sergančiųjų mikrobiotos“, - paskelbė Guarneris.
"Gerosios bakterijos"
Anot tyrėjo, šie duomenys atveria strategijas, kaip bandyti atkurti šias rūšis mitybinėmis intervencijomis: skiriant skaidulas, prebiotikus, kurie padeda selektyviai auginti kai kurias rūšis, arba probiotikus.
Šios nežinomos bakterijos greičiausiai yra vadinamosios gerosios bakterijos, nes jos nėra tipiškos infekciją sukeliančios bakterijos, taip pat nėra žinomos ar išskirtos anksčiau. Anot Guarnerio, aptiktos bakterijos negali būti išskirtos, nes "beveik neabejotinai jos neišgyventų už storosios žarnos, kad būtų persodintos".
Už darbą atsakingas asmuo ir VHIR fiziologijos ir virškinimo patofiziologijos grupės tyrėjas nurodė, kad aptiktos naujos rūšys „nėra auginamos, yra labai jautrios deguoniui, tai yra, yra labai griežtos anaerobų rūšys ir sukuria didelę priklausomybę nuo savo aplinkos, kad galėtų. išgyventi “. „Dėl tos pačios priežasties, eidami į duomenų bazes, neradome pėdsakų ir iki šiol nieko apie juos nežinojome“, - sakė A. Guarneris.
Skirtingos metagenominės rūšys
Atradimas buvo įmanomas dėl naujo požiūrio į bioinformatinę analizę, kuri leido šioms rūšims „virsti“.
"Šiuo metu, pasak Guarnerio, tik 10% sekvenuotos genetinės medžiagos yra žinomi 95% patikimumu. Tai palieka didžiulę pilką sritį, kurioje šiuo metu dirbama."
Tyrimo metu buvo aptikta 741 skirtinga metagenominė rūšis, pavadinta dėl negalėjimo jiems priskirti pavadinimo. Priešindamiesi duomenų bazėms, tyrėjai pamatė, kad 115 iš šių rūšių jau buvo žinomos, o 518 - nežinomos; likę 108 yra iš dalies žinomi.
"Dabar mes žinome, kaip atrodo šių metagenominių rūšių genomas, bet ne jų vardus ir pavardes", - aiškino Guarneris.
Nedaug yra tokių rūšių, kurios nėra žinomos, tačiau jų lytis ar šeima, kuriai jie priklauso, ir maždaug 200 aprašytųjų metagenominių rūšių niekaip negali būti klasifikuojamos, nes daugiau nei 80% jų genų yra visiškai nežinomi. šiandien
Žmogus turi 600 000 mikrobų genų
Mokslininkų teigimu, žmonėse gyvenančių mikroorganizmų yra apie 100 milijardų, tai yra 10 kartų daugiau nei bendras žmogaus ląstelių skaičius.
Pradiniai to paties projekto rezultatai, 2010 m., Parodė 3 300 000 skirtingų genų, paverčiamų 20 000 skirtingų funkcijų, iš kurių 5000 iki šiol nebuvo visiškai žinomi.
Kiekvienas žmogus turi apie 600 000 šių mikrobų genų ir 300 000 nuolat kartojasi tarp visų asmenų. „Šiame naujame tyrime skaičius padauginamas iš trijų ir pasiekiama 9 879 896 skirtingi genai“, - teigė A. Guarneris.
Šaltinis:
