2013 m. Birželio 24 d., Pirmadienis. Australijos ir JAV mokslininkai teikia naujų žinių, kad suprastų trimatę genomo struktūrą - vieną didžiausių iššūkių, su kuriuo šiuo metu susiduria genomikos ir genetikos sritis, kurio išvadas jis skelbia savo skaitmeniniame leidinyje “. Gamtos genetika “.
Maždaug trys metrai DNR yra glaudžiai sulankstyti kiekvienos mūsų kūno ląstelės branduolyje, o tai leidžia vieniems genams „ekspresijuotis“ ar suaktyvėti, išskyrus kitus. Gydytojai Timas Merceris ir Johnas Mattickas iš Garvano medicinos tyrimų instituto Sidnėjuje ir Vašingtono universiteto Sietle profesorius Johnas Stamatoyannopoulos didelę skiriamąją gebą analizavo genomo 3D struktūrą.
Genus sudaro „egzonai“ ir „intronai“, iš kurių pirmosios yra sekos, koduojančios ir ekspresuojančios baltymus, o paskutinės - nekoduojančios DNR ruožas terpėje. Genai, nukopijuojami arba perrašomi iš DNR RNR, intronų sekos yra supjaustomos arba „suskaidomos“, o likę egzonai yra grandinuojami kartu, kad būtų sudaryta seka, užkoduojanti baltymą. Tas pats genas gali generuoti skirtingus baltymus, priklausomai nuo to, kokie egzonai yra skeveldrūs.
Panaudodamas didelius duomenų iš „ENCODE“ duomenų kiekius, daktaras Timas Merceris ir jo kolegos padarė išvadą apie genomo sulankstymą ir nustatė, kad net geno viduje atrinkti egzonai yra lengvai veikiami. „Įsivaizduokite ilgą ir nepaprastai sudėtingą vynmedį, jo susuktas šakas, kuriose yra keletas vynuogių, kurias galima lengvai nuplėšti, o paslėpti kitas - nepasiekiamoje vietoje“, - jis pateikia pavyzdį. Merceris
"Tuo pačiu metu įsivaizduokite tingų vaisių skynėją, kuris tiesiog rinks vynuoges po ranka, - priduria jis. - Tas pats principas galioja ir genomui. Tam tikri genai ir net specifiniai egzonai yra sudedami." Šia prasme šis tyrėjas pabrėžia, kad pastaraisiais metais mokslininkai pradėjo vertinti, kaip genomo lankstymas padeda nustatyti, kaip jis išreiškiamas ir reguliuojamas.
"Šis tyrimas pateikia pirmąjį požymį, kad trimatė genomo struktūra gali paveikti genų sujungimą. Galime daryti išvadą, kad genomas sulankstytas taip, kad promotoriaus sritis, seka, pradedanti geno transkripciją, yra rasti šalia egzonų ir jie visi nuvežami į transkripcijos aparatą “, - pabrėžia jis.
"Tai palaiko naują požiūrį į daiktus, kad genomas lenkiasi aplink transkripcijos mechanizmą, o ne atvirkščiai. Tie genai, kurie liečiasi su transkripcijos mechanizmais, gauna kopijas, o tos dalys, kurios orbituojasi toli jie ignoruojami “, - reziumuoja šis tyrėjas.
Šaltinis:
Žymės:
Cut-Ir-Vaikas Šeima Žodynas
Maždaug trys metrai DNR yra glaudžiai sulankstyti kiekvienos mūsų kūno ląstelės branduolyje, o tai leidžia vieniems genams „ekspresijuotis“ ar suaktyvėti, išskyrus kitus. Gydytojai Timas Merceris ir Johnas Mattickas iš Garvano medicinos tyrimų instituto Sidnėjuje ir Vašingtono universiteto Sietle profesorius Johnas Stamatoyannopoulos didelę skiriamąją gebą analizavo genomo 3D struktūrą.
Genus sudaro „egzonai“ ir „intronai“, iš kurių pirmosios yra sekos, koduojančios ir ekspresuojančios baltymus, o paskutinės - nekoduojančios DNR ruožas terpėje. Genai, nukopijuojami arba perrašomi iš DNR RNR, intronų sekos yra supjaustomos arba „suskaidomos“, o likę egzonai yra grandinuojami kartu, kad būtų sudaryta seka, užkoduojanti baltymą. Tas pats genas gali generuoti skirtingus baltymus, priklausomai nuo to, kokie egzonai yra skeveldrūs.
Panaudodamas didelius duomenų iš „ENCODE“ duomenų kiekius, daktaras Timas Merceris ir jo kolegos padarė išvadą apie genomo sulankstymą ir nustatė, kad net geno viduje atrinkti egzonai yra lengvai veikiami. „Įsivaizduokite ilgą ir nepaprastai sudėtingą vynmedį, jo susuktas šakas, kuriose yra keletas vynuogių, kurias galima lengvai nuplėšti, o paslėpti kitas - nepasiekiamoje vietoje“, - jis pateikia pavyzdį. Merceris
"Tuo pačiu metu įsivaizduokite tingų vaisių skynėją, kuris tiesiog rinks vynuoges po ranka, - priduria jis. - Tas pats principas galioja ir genomui. Tam tikri genai ir net specifiniai egzonai yra sudedami." Šia prasme šis tyrėjas pabrėžia, kad pastaraisiais metais mokslininkai pradėjo vertinti, kaip genomo lankstymas padeda nustatyti, kaip jis išreiškiamas ir reguliuojamas.
"Šis tyrimas pateikia pirmąjį požymį, kad trimatė genomo struktūra gali paveikti genų sujungimą. Galime daryti išvadą, kad genomas sulankstytas taip, kad promotoriaus sritis, seka, pradedanti geno transkripciją, yra rasti šalia egzonų ir jie visi nuvežami į transkripcijos aparatą “, - pabrėžia jis.
"Tai palaiko naują požiūrį į daiktus, kad genomas lenkiasi aplink transkripcijos mechanizmą, o ne atvirkščiai. Tie genai, kurie liečiasi su transkripcijos mechanizmais, gauna kopijas, o tos dalys, kurios orbituojasi toli jie ignoruojami “, - reziumuoja šis tyrėjas.
Šaltinis:
